Галина Юрьевна Ризниченко |
В конце семестра проводится конференция, на которой наиболее активные студенты рассказывают о применении методов математического моделирования в интересующей их области знаний. Участие в конференции подразумевает самостоятельное мини-исследование по одной из тем курса, согласованной с преподавателем. К участию в конференции допускаются студенты, активно работавшие в семестре, написавшие все контрольные работы, ответившие на вопросы лектора на форуме и получившие рекомендацию преподавателя семинаров. На конференции могут быть представлены работы, в рамках которых студенты самостоятельно провели анализ и/или моделирование биологической системы.
Условия допуска к студенческой конференции:
- Написание всех контрольных работ на положительную оценку.
- Ответы на вопросы лектора на форуме.
- Рекомендация преподавателя, ведущего семинарские занятия.
- Студенты должны привнести что-то свое в модель: посчитать или построить. Просто реферат не принимается!
- Студенты должны за несколько дней до конференции предоставить преподавателю презентацию на рецензию.
Внимание: в 2021 году студенческая конференция проводиться не будет.
Конференция 2018 года
Петров Егор Андреевич, Никодимов Сергей Сергеевич Моделирование процессов фотосистемы 2 для количественного анализа индукции флуоресценции, измеренной на побегах липы
Нишкомаева Екатерина Максимовна Моделирование работы шаперонов и их роли в клеточном старении
Власова Александра Андреевна Моделирование направленного транспорта лекарственных веществ с помощью системы линейных дифференциальных уравнений
Охтиенко Анастасия Сергеевна SIR модель распространения эпидемий
Гаврилова Виктория Андреевна Базовая математическая модель иммунного ответа
Еремеева Елизавета Алексеевна Модель Т-клеточной супрессии при аллерген-специфичной иммунотерапии
Капитонова Анна Алексеевна, Булавко Егор Сергеевич Анализ обобщенной модели "осциллятор Дуффинга"
Конференция 2017 года (осень)
- Варшавская Ксения Исследование взаимодействия белков p53 и Mdm2 в процессе апоптоза
- Загирова Диана Модель сигнального пути Rb-E2F, как одного из основных путей развития ракового фенотипа
- Беляева Валентина Модель развития раковой опухоли при инсулинорезистентности
- Шомурадова Алина Математическое моделирование опухолевого роста в условиях антиангиогенной терапии
- Овчинникова Виктория Математическая модель лекарственного воздействия на растущую опухоль
- Базаревич Мария Анализ взаимодействия Т-лимфоцитов с опухолевыми клетками в иммунном ответе на основе модели Вольтерра "хищник-жертва" с использованием функции Михаэлиса-Ментен
- Баринова Анна Вакцинация Т-клетками при аутоиммунном энцефаломиелите
- Грешнова Александра Влияние обратимого ингибирования на кинетику ферментативных реакций
- Гриценко Георгий Индуцированные колебания в нейронах при смене циклов быстрой медленной фаз сна
- Янушкевич Сергей Формирование структур при моделировании неустойчивости Тьюринга в двумерной реакционно-диффузионной системе
- Ратновская Анна Моделирование динамики популяции Bonellia viridis Roland
- Биба Дмитрий Отбор генотипов в популяции при наличии генов, влияющих на вероятность успеха несущего их сперматозоида
- Полинова Альмина Динамика численности носителей аллеля HbS и людей, гомозиготных по аллелю HbA, в областях распространения малярии
- Балабан Мария Моделирование популяционной динамики приобретенного иммунитета к паразитарной инфекции
- Мирзоева Ниссо Математическая модель распространения эпидемий на примере лихорадки Эбола
- Минцева Мария Математическая модель взаимодействия загрязнения с окружающей средой
- Жернова Даяна Облигатный симбиоз в отношениях опылитель-опыляемое растение у Ficus и ос из семейства Agaonidae
- Савина Юлия Исследование динамики фотосинтеза на простой модели
- Алексеева Надежда Модель роста и резорбции кости
Конференция 2017 года (весна)
Харыбина Екатерина Витальевна (кафедра клеточной биологии и гистологии, преподаватель Фурсова П.В.) Модель аутоиммунитета млекопитающих Алкин Никита Александрович (кафедра микологии и альгологии, преподаватель Дьяконова А.Н.) Исследование SI и SIR моделей инфекционных заболеваний Марченко Марина Алексеевна (кафедра биохимии, преподаватель Плюснина Т.Ю.) Модель действия лекарства на протонную помпу желудка Якушев Александр Сергеевич (кафедра зоологии беспозвоночных, преподаватель Устинин Д.М.) Моделирование уравнения состояния артериальных сосудов Decapoda (Arthropoda: Crustacea) по аналогии с высшими Vertebrata Иванова Софья Дмитриевна (кафедра молекулярной биологии, преподаватель Нестеренко А.М.) Изучение модели взаимодействия двух транскрипционных факторов, включающей самоактивацию и взаимную репрессию Ахметов Всеволод Владимирович (кафедра биохимии, преподаватель Плюснина Т.Ю.) Анализ зависимости предэкспоненциального параметра формулы Гомперца-Мейкема от уровня развития медицины страны
Конференция 2016 года
19 апреля, 1055
- Галков Максим Дмитриевич (кафедра физиологии животных и человека)
Дискретные модели, описывающие динамику изменения объема крови в участке микроциркуляторного русла
- Четыркина Маргарита Руслановна (кафедра физиологии животных и человека)
Модели регуляции концентрации гормона пролактина
- Довбнюк Ксения Олеговна (кафедра физиологии животных и человека)
Модель, описывающая динамику численности клеток, входящих в состав опухоли и клеток ее окрестности
- Табачник Алексей Константинович (кафедра зоологии беспозвоночных)
Математическое моделирование иммунной системы морского ежа
- Карачевцева Маргарита Алексеевна (кафедра биоинженерии)
Математическая модель оптимальной стратегии химиотерапии
- Черных Михаил Александрович (кафедра биоинженерии)
Влияние инфекции на динамику популяции
- Вьюшков Владимир Сергеевич (кафедра молекулярной биологии)
Моделирование колебаний в простейшем генетическом контуре
- Володина Ася Владиславовна (кафедра вирусологии)
Виртуальные тропы реальных лекарств
- Босая Анастасия Александровна (кафедра биоорганической химии)
Моделирование по гомологии РНК-зависимой РНК-полимеразы вируса Зика
20 апреля, 900
- Шлык Валерия Ивановна (кафедра молекулярной биологии)
Мультисубстратная реакция. Сравнение механизмов пинг-понг и тройного комплекса
- Миловская Ирина Георгиевна (кафедра биохимии)
Математическое моделирование иммунного ответа
- Фролова Вероника Сергеевна (кафедра эмбриологии)
Исследование модели «Два хищника – жертва»
- Устинова Елена Николаевна (кафедра биологической эволюции)
Мутуалистические отношения в системе растение-опылитель
- Шнайдер Элина Дмитриевна (кафедра генетики)
Математическое моделирование однолетних травянистых растений на примере Пастушьей сумки
- Лукьянов Даниил Константинович (кафедра биохимии)
Изучение уровня диффузии белка Noggin4 в процессах образования головной части Xenopus laevis
- Манюхина Виктория Олеговна (кафедра физиологии высшей нервной деятельности)
Исследование модели нейрона Морриса-Лекара и построение нейронной сети на ее основе
- Евтушенко Надежда Алексеевна (кафедра физиологии высшей нервной деятельности)
Моделирование процессов в нейронных сетях с четным циклическим торможением
По итогам выступлений на конференции следующие студенты получают за экзамен оценку “отлично”:- Галков Максим Дмитриевич, каф. физиологии животных и человека
- Четыркина Маргарита Руслановна, каф. физиологии животных и человека
- Довбнюк Ксения Олеговна, каф. физиологии животных и человека
- Миловская Ирина Георгиевна, каф. биохимии
- Табачник Алексей Константинович, каф. зоологии беспозвоночных
- Карачевцева Маргарита Алексеевна, каф. биоинженерии
- Вьюшков Владимир Сергеевич, каф. молекулярной биологии
- Босая Анастасия Александровна, каф. биоорганической химии
- Фролова Вероника Сергеевна, каф. эмбриологии
- Устинова Елена Николаевна, каф. биологической эволюции
- Шнайдер Элина Дмитриевна, каф. генетики
- Манюхина Виктория Олеговна, каф. высшей нервной деятельности
- Евтушенко Надежда Алексеевна, каф. высшей нервной деятельности
Выбор – оценка «хорошо» или пойти на досрочный экзамен – предоставляется следующим студентам:- Черных Михаил Александрович, каф. биоинженерии
- Володина Ася Владиславовна, каф. вирусологи
- Шлык Валерия Ивановна, каф. молекулярной биологии
Оценка не поставлена, но предоставляется возможность досрочной сдачи экзамена студенту- Лукьянову Даниилу Константиновичу, каф. биохимии
Конференция, прошедшая 21 и 22 апреля 2015 года
- Голяко Иван Александрович, Подшивалова Елизавета Сергеевна (Кафедра физиологии животных, группа 209)
Математическая модель реконструкции костной ткани
- Колотова Дарья Евгеньевна, Новичихина Клара Васильевна (Кафедра физиологии животных, группа 209)
Исследование модели "Гипофиз - щитовидная железа"
- Короткова Дарья Дмитриевна, Гольцова Александра Сергеевна (Кафедра эмбриологии, группа 212)
Моделирование процессов регенерации
- Абрикосова Виктория Александровна, Гарифулина Александра Игоревна (Кафедра биоорганической химии, группа 220)
Математическое моделирование опухолевых новообразований
- Шиян Александра Сергеевна (Кафедра зоологии беспозвоночных, группа 202)
Изучение динамики численности популяций двух видов пещерных мизид при помощи модели конкуренции видов
- Веко Егор Николаевич, Пронкина Кира Олеговна (Кафедра энтомологии, группа 204)
Исследование динамики численности каст муравьев в модели симбиоза
- Алемасцева Екатерина Алексеевна (Кафедра генетики, группа 213), Ветрова Александра Александровна (Кафедра эмбриологии, группа 212)
Анализ численности австралийских крокодилов с температурной детерминацией пола
- Большакова Алиса Андреевна, Дубровская Анна Сергеевна (Кафедра зоологии позвоночных, группа 201)
Статистическая модель для оценки случайности совпадения песенной активности двух особей разных видов птиц
- Мищанчук Ксения Александровна, Шепелева Екатерина Андреевна (Кафедра высших растений, группа 207)
Прогнозирования начала цветения Betula sp.
- Шадрин Валериан Сергеевич, Шошина Олеся Олеговна (Кафедра биологической эволюции, группа 221)
Математическая модель бактериального мата
- Бутаева Галина Булатовна, Голубева Александра Игоревна (Кафедра альгологии и микологии, группа 206)
Кинетика модели проточного культиватора и биологические причины инерции
- Найденкова Анастасия Дмитриевна (Кафедра зоологии беспозвоночных, группа 202), Торговкина Софья Михайловна (Кафедра физиологии высшей нервной деятельности, группа 210)
О синхронизации в нейронной сети на основе модели электрического синапса
- Трошев Дмитрий Вадимович (Кафедра физиологии высшей нервной деятельности, группа 210), Пискарева Арина Алексеевна (Кафедра биоинженерии, группа 226)
Исследование колебательных процессов регуляции синтеза белка
- Грибкова Анна Кирилловна, Маттис Мария Андреевна (Кафедра биоинженерии, группа 226)
Исследование положительных обратных связей через кофакторы в процессах свертывания крови. Математическая модель Семенова и Ханина
- Гринченко Варвара Дмитриевна, Щёлоков Дмитрий Александрович (Кафедра биоинженерии, группа 226)
Кооперативные явления ферментативной кинетики
- Воробьева Виктория Алексеевна, Рябкова Наталья Сергеевна (Кафедра биохимии, группа 218)
Регуляция синтеза белка и блокирование гена
- Слонимский Юрий Борисович (Кафедра биохимии, группа 218)
Математическая модель регуляции прогестерона и лютеинизирующего гормона
- Кочерыжкина Елена Владимировна, Пирогов Сергей Александрович (Кафедра молекулярной биологии, группа 219)
Стохастическая модель транскрипции с отрицательной обратной связью с учетом димеризации белка
- Маслов Иван Олегович, Федорина Анастасия Сергеевна (Кафедра биоорганической химии, группа 220)
Исследование динамики концентрации связанных тиреоидных гормонов в наружном слое фолликула щитовидной железы
- Матюлько Ирина Сергеевна, Мигулина Наталия Алексеевна (Кафедра физиологии животных, группа 209)
Математическая модель регуляции энергетического обмена действием лептина у мышей
- Деревянко Полина Константиновна, Козлова Анастасия Львовна (Кафедра молекулярной биологии, группа 219)
Разработка алгоритма поиска генетических маркеров, дискриминирующих заданную выборку организмов
- Бортников Федор Михайлович (Кафедра альгологии и микологии, группа 206)
Механохимическая модель амебоидной подвижности плазмодия Physarum polycephalum
- Стурова Анна Игоревна (Кафедра физиологии животных, группа 209)
Модель сокращения скелетной мускулатуры
Материалы конференции, прошедшей 22, 23, 25 и 29 апреля 2014 года
Часть 1
» Видеозапись (YouTube)
» Видеозапись (AVI)
» Аудиозапись (MP3)
- Дудорова Анастасия Валерьевна (Зоология позвоночных)
Исследование динамики численности рыжей полевки с помощью функций последования
- Горелышева Дарья, Неклюдов Борис (Зоология беспозвоночных)
Отбор циклов с периодом - простым числом в модели «хищник-жертва» с использованием методов компьютерного моделирования
- Богатырева Варвара (Энтомология)
Модель начальных этапов построения термитника
- Бухтоярова Наталья Юрьевна (Микология и альгология)
Математическое моделирование культивируемой популяции одноклеточной водоросли Chlorella vulgaris
- Карпунина Полина Владимировна (Высшие растения)
Моделирование филлотаксиса вегетативных побегов
- Абрамов Евгений Александрович, Голикова Екатерина Андреевна (Физиология человека и животных)
Регуляция гемопоэза
Часть 2
» Видеозапись
» Видеозапись (AVI)
» Аудиозапись (MP3)
- Иванова Александра, Суханова Любовь (Физиология человека и животных)
Математическая модель гемодинамики элементарного сосудистого участка
- Леонидова Светлана Валерьевна, Молчанова Татьяна Александровна (Физиология человека и животных)
ВИЧ: моделирование комбинированной лекарственной терапии
- Аксёнова Юлия, Брошевицкая Надежда Дмитриевна (Физиология высшей нервной деятельности)
Исследование механизма генетического заболевания анальгезии на основе модели Ходчкина-Хаксли
- Полищук Александра Андреевна, Федотова Анна Алексеевна (Физиология высшей нервной деятельности)
Моделирование неспецифического переключения в сигналах электрической активности головного мозга
- Солодков Роман Викторович (Физиология высшей нервной деятельности)
Модель динамики частоты сердечных сокращений в условиях физической нагрузки
- Басалова Наталья Андреевна, Капитанова Ксения Сергеевна, Матвеева Татьяна Валерьевна (Клеточная биология и гистология)
Модели в геронтологии. Общие теории старения
Часть 3
» Видеозапись
» Видеозапись (AVI)
» Аудиозапись (MP3)
- Хамидуллина Альвина Ильвировна, Ялчина Рената Салаватовна (Клеточная биология и гистология)
Математическое моделирование острой воспалительной реакции
- Золотарева Татьяна Александровна, Конеева Цаган Олеговна (Эмбриология)
Структурообразование при формировании зубов у A. mississippiensis
- Коробко Екатерина Сергеевна (Эмбриология)
Модель самоорганизации эмбриональных клеточных пластов
- Паршина Елена Анатольевна (Эмбриология), Силина Виктория Валерьевна (Генетика)
Математическая модель Maini «часов и волны» на примере сомитогенеза
- Лавренова Виктория (1 курс)
Исследование модели «хищник – две жертвы»
- Костюк Александр Игоревич (Биохимия), Белоусова Юлия Владимировна (Физиология человека и животных)
Морфологический и молекулярно-филогенетический (ярДНК ITS1, 5.8s rRNA, ITS2 ) анализы мятликов (Poa) в связи с их систематикой и диагностикой
Часть 4
» Видеозапись
» Видеозапись (AVI)
» Аудиозапись (MP3)
- Лопатухина Елена Владимировна (Биохимия)
Динамика распространения эпидемий
- Зинина Валерия Вадимовна, Свешникова Анастасия Александровна (Молекулярная биология)
Моделирования белков на примере ядерного рецептора CAR и его лиганд-рецепторных комплексов
- Миляева Полина Андреевна (Генетика)
Нейтральная теория молекулярной эволюции
- Пылова Наталья Игоревна (Генетика)
Моделирование кинетики индуцибельных белковых комплексов SOS-системы бактерий E. coli
- Никишова Екатерина (Гидробиология)
Модель биологической очистки почвы и зоны аэрации от загрязнения нефтепродуктами
Часть 5
» Видеозапись
» Видеозапись (AVI)
» Аудиозапись (MP3)
- Белова Вера Александровна (Генетика)
Моделирование генных сетей
- Ибнеева Лилия Ренатовна (Биохимия)
Математическая модель работы АТФ-синтазы как вращающегося молекулярного мотора
- Гиголаев Андрей Михайлович, Полянина Дарья Леонидовна (Биоорганическая химия)
Математическое моделирование кальциевого гомеостаза в гладкомышечных клетках в условиях модуляции активности кальциевого насоса плазматической мембраны
- Воробьева Екатерина, Войтова Маргарита (Микробиология)
Модель Моно и ее применение в микробиологии
- Зыкова Анна Андреевна, Стрелкова Дарья Михайловна (Вирусология)
Хронические вирусные инфекции клеточных популяций
Часть 6
» Видеозапись
» Видеозапись (AVI)
» Аудиозапись (MP3)
- Ефимова Дарья (Биоинженерия)
Фолдинг белка
- Гебрук Анна (Зоология беспозвоночных)
Первоописание и 3D реконструкция предротового целома брахиоподы Lingula anatina. 3D реконструкция: видео
- Борисова Полина (Зоология беспозвоночных)
Метод геометрической морфофометрии и его эффективность по сравнению с классической морфометрией
- Воробьева Ольга (Зоология беспозвоночных)
Возможности анализа состояния конституционного гетерохроматина генома человека с помощью цифровых технологий
- Земледельцев Денис (Зоология беспозвоночных)
Поиск протяженных повторов в геномах на основе спектрально-аналитического метода
- Тарасов Кирилл (Биоинженерия)
Математическое моделирование пространственно-временной динамики возрастной структуры популяции растений
- Зайцев Пётр (Биоинженерия)
Иммобилизация флуоресцентного зонда в молекулы фермента
- Рябых Григорий (Биоинженерия)
О фракталах
Часть 7
» Видеозапись
» Видеозапись (AVI)
» Аудиозапись (MP3)
- Глущенко Евгений (Биоинженерия)
Клеточные автоматы против классических систем дифференциальных уравнений. Статья: First replicating creature spawned in life simulator
- Филиппова Екатерина (Биоинженерия)
Математическая модель стрессового клеточного ответа на накопление неправильно свернутых белков в эндоплазматическом ретикулуме
- Михайлова Мария (Биоинженерия)
Исследование системы Фитцхью и Нагумо
- Соколова Анастасия (Биоинженерия)
Анализ модели иммунного ответа на вирусную инфекцию
- Илларионова Анастасия (Биоинженерия)
Модель развития солидной опухоли
- Титов Алексей (Биоинженерия)
Биотехнология в рамках модели Моно
- Савельева Мария (Биоинженерия)
Рост опухоли
Часть 8
» Видеозапись
» Видеозапись (AVI)
» Аудиозапись (MP3)
- Сидоров Андрей (Биофизика)
Триггер Жакоба и Моно. Модель биохимической регуляции белкового синтеза
- Боков Максим (Биофизика)
Нейронная модель Фитцхью и Нагумо
- Жуков Олег (Биофизика)
Колебания концентрации кальция в гепатоцитах печени. Исследование модели
- Дубянская Евгения, Хомич Дарья (Биофизика)
Модель клеточного цикла
- Кулешов Павел, Буруева Жибзема (Биофизика)
Исследование модели Майнхарда-Гирера
- Моисеенко Денис (Биофизика)
Модели регуляции активности оперона с отрицательной обратной связью
Материалы конференции, прошедшей 23 апреля 2013 года
Материалы конференции, прошедшей 18 апреля 2012 года
|