Галина
Юрьевна
Ризниченко

Дополнительная информация

Связь с преподавателями

Учебники и учебные пособия

Дополнительная литература

  • Алиев Р. Р. Моделирование электрической активности сердца на компьютере. В сб. Медицина в зеркале информатики. С. 81-100, М., Наука, 2008
  • Базыкин А. Д. Нелинейная динамика взаимодействующих популяций. Изд. РХД, М–Ижевск, 2003
  • Ванаг В. К. Диссипативные структуры в реакционно-диссипативных системах. Изд. ИКИ–РХД. М.–Ижевск, 2008
  • Геронтология in Silico: становление новой дисциплины. Математическиемодели, анализ данных и вычислительные эксперименты. М., Изд. Бином, 2007
  • Динамические модели процессов в клетках и субклеточных наноструктурах. Изд. РХД–ИКИ, 2010
  • Иваницкий Г. Р., Кринский В. И., Сельков Е. Е. Математическая биофизика клетки. М., Наука, 197
  • Капица С. П. Общая теория роста человечества. М., Наука. 1999
  • Лоскутов А. Ю., Михайлов А. С. Основы теории сложных систем. М.–Ижевск, Изд. РХД, 2007
  • Мазуров М. Е. Идентификация математических моделей нелинейных динамических систем. Изд. РХД.,  М–Ижевск, 2008
  • Минкевич И. Г. Материально-энергетический баланс и кинетика роста микроорганизмов. Изд. РХД, 2005
  • Мюррей Д. Математическая биология, том 1. Введение. Изд. РХД-ИКИ, 2009
  • Мюррей Д. Математическая биология, том 2. Пространственные модели и их приложение в биомедицине. Изд. РХД–ИКИ, 2011
  • Полежаев А. А. Механизмы биологического морфогенеза. В: Модели процессов в клетках и субклеточных наноструктурах. По ред. Г.Ю.Ризниченко, А.Б.Рубина. с. 337-355. Изд. ИКИ, М.–Ижевск, 2010
  • Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Биофизическая динамика продукционных процессов. М.–Ижевск, 2004
  • Романовский Ю. М., Степанова Н. В., Чернавский Д. С. Математические модели в биофизике. М., 1976
  • Романовский Ю. М., Степанова Н. В., Чернавский Д. С. Математическая биофизика. М., Наука, 1984
  • Романовский Ю. М., Степанова Н. В., Чернавский Д. С. Математическое моделирование в биофизике. М-Ижевск, 2004
  • Рубин А. Б. Биофизика. Часть 1. М., 1999
  • Рубин А. Б., Шинкарев В. П. Транспорт электронов в биологических системах. Наука, М., 1984
  • Свирежев Ю. М., Логофет Д. О. Устойчивость биологических сообществ. М., 1978
  • Ходжкин А. Нервный импульс. М., Мир, 1965
  • Чернышенко С. В. Нелинейные методы анализа динамики лесных биогеоценозов. Днепропетровск, 2005
  • Эбелинг В. Образование структур при необратимых процессах. Введение в теорию диссипативных структур. Изд РХД, М–Ижевск, 2005

Многие из этих и книг могут быть найдены в электронной библиотеке кафедры биофизики. Доступ к электронной библиотеке возможен только с компьютеров, расположенных на биологическом факультете МГУ.

Интернет-сайты

  • Информационная система «Динамические модели в биологии»
    http://dmb.biophys.msu.ru/
  • Кафедра биофизики биологического факультета МГУ им. М. В. Ломоносова
    http://www.biophys.msu.ru/
  • Группа молекулярной динамики кафедры биоинженерии биологического факультета МГУ им. М. В. Ломоносова
    http://www.moldyn.ru/
  • Объединённый центр вычислительной биологии и биоинформатики
    http://www.jcbi.ru/
  • «Биомолекула» – научно-популярный сайт, посвящённый молекулярным основам современной биологии и практическим применениям научных достижений в медицине и биотехнологии
    http://www.biomolecula.ru/
  • Институт математических проблем биологии РАН
    http://www.impb.ru/

Базы данных

  • MedLine (PubMed) – биомедицинская библиографическая информация
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
  • BLAST – сравнение нуклеотидных и аминокислотных последовательностей
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/
  • KEGG – попытка компьютеризировать все современное знание в молекулярной и клеточной биологии в терминах метаболических путей
    http://www.genome.ad.jp/kegg/
  • MetaCyc – набор экспериментально подтвержденных метаболических путей
    http://metacyc.org/
  • BRENDA – информация по белкам
    http://www.brenda-enzymes.info/
  • ENZYME – номенклатура ферментов
    http://www.expasy.ch/enzyme/
  • Protein Data Bank (PDB) – набор экспериментально изученных трёхмерных структур белков и нуклеиновых кислот
    http://www.pdb.org/

Программное обеспечение

Для выполнения практических заданий Вам понадобится программа TraX. Вы можете загрузить TraX для Python для запуска на Вашем компьютере:

Для запуска понадобится установленный интерпретатор Python с установленными пакетами numpy, scipy и matplotlib (инструкция по установке и настройке). Можно загрузить автономную версию TraX (для операционной системы Windows), включающую в себя настроенный интерпретатор.