Галина
Юрьевна
Ризниченко

Студенческая конференция


В конце семестра проводится конференция, на которой наиболее активные студенты рассказывают о применении методов математического моделирования в интересующей их области знаний. Участие в конференции подразумевает самостоятельное мини-исследование по одной из тем курса, согласованной с преподавателем. К участию в конференции допускаются студенты, активно работавшие в семестре, написавшие все контрольные работы, ответившие на вопросы лектора на форуме и получившие рекомендацию преподавателя семинаров.

На конференции могут быть представлены работы, в рамках которых студенты самостоятельно провели анализ и/или моделирование биологической системы. Выступление на конференции оценивается комиссией, состоящей из нескольких преподавателей. По результатам доклада на конференции студент может получить автоматом оценку за экзамен с учетом работы в семестре и баллов за контрольные.

Условия допуска к студенческой конференции:

  • Написание всех контрольных работ на положительную оценку.
  • Ответы на вопросы лектора на форуме.
  • Рекомендация преподавателя, ведущего семинарские занятия.
  • Студенты должны привнести что-то свое в модель: посчитать или построить. Просто реферат не принимается!
  • Студенты должны за несколько дней до конференции предоставить преподавателю презентацию на рецензию.

Выступление на конференции не гарантирует автомата. Решение об оценке принимается присутствующими на выступлении студента преподавателями, и оценка выставляется только в том случае, если все преподаватели с ней согласны.

 

Конференция 2017 года (весна)

  • Харыбина Екатерина Витальевна (кафедра клеточной биологии и гистологии, преподаватель Фурсова П.В.)
    Модель аутоиммунитета млекопитающих
  • Алкин Никита Александрович (кафедра микологии и альгологии, преподаватель Дьяконова А.Н.)
    Исследование SI и SIR моделей инфекционных заболеваний
  • Марченко Марина Алексеевна (кафедра биохимии, преподаватель Плюснина Т.Ю.)
    Модель действия лекарства на протонную помпу желудка
  • Якушев Александр Сергеевич (кафедра зоологии беспозвоночных, преподаватель Устинин Д.М.)
    Моделирование уравнения состояния артериальных сосудов Decapoda (Arthropoda: Crustacea) по аналогии с высшими Vertebrata
  • Иванова Софья Дмитриевна (кафедра молекулярной биологии, преподаватель Нестеренко А.М.)
    Изучение модели взаимодействия двух транскрипционных факторов, включающей самоактивацию и взаимную репрессию
  • Ахметов Всеволод Владимирович (кафедра биохимии, преподаватель Плюснина Т.Ю.)
    Анализ зависимости предэкспоненциального параметра формулы Гомперца-Мейкема от уровня развития медицины страны

 

Конференция 2016 года

19 апреля, 1055

  • Галков Максим Дмитриевич (кафедра физиологии животных и человека)
    Дискретные модели, описывающие динамику изменения объема крови в участке микроциркуляторного русла
  • Четыркина Маргарита Руслановна (кафедра физиологии животных и человека)
    Модели регуляции концентрации гормона пролактина
  • Довбнюк Ксения Олеговна (кафедра физиологии животных и человека)
    Модель, описывающая динамику численности клеток, входящих в состав опухоли и клеток ее окрестности
  • Табачник Алексей Константинович (кафедра зоологии беспозвоночных)
    Математическое моделирование иммунной системы морского ежа
  • Карачевцева Маргарита Алексеевна (кафедра биоинженерии)
    Математическая модель оптимальной стратегии химиотерапии
  • Черных Михаил Александрович (кафедра биоинженерии)
    Влияние инфекции на динамику популяции
  • Вьюшков Владимир Сергеевич (кафедра молекулярной биологии)
    Моделирование колебаний в простейшем генетическом контуре
  • Володина Ася Владиславовна (кафедра вирусологии)
    Виртуальные тропы реальных лекарств
  • Босая Анастасия Александровна (кафедра биоорганической химии)
    Моделирование по гомологии РНК-зависимой РНК-полимеразы вируса Зика

 20 апреля, 900

  • Шлык Валерия Ивановна (кафедра молекулярной биологии)
    Мультисубстратная реакция. Сравнение механизмов пинг-понг и тройного комплекса
  • Миловская Ирина Георгиевна (кафедра биохимии)
    Математическое моделирование иммунного ответа
  • Фролова Вероника Сергеевна (кафедра эмбриологии)
    Исследование модели «Два хищника – жертва»
  • Устинова Елена Николаевна (кафедра биологической эволюции)
    Мутуалистические отношения в системе растение-опылитель
  • Шнайдер Элина Дмитриевна (кафедра генетики)
    Математическое моделирование однолетних травянистых растений на примере Пастушьей сумки
  • Лукьянов Даниил Константинович (кафедра биохимии)
    Изучение уровня диффузии белка Noggin4 в процессах образования головной части Xenopus laevis
  • Манюхина Виктория Олеговна (кафедра физиологии высшей нервной деятельности)
    Исследование модели нейрона Морриса-Лекара и построение нейронной сети на ее основе
  • Евтушенко Надежда Алексеевна (кафедра физиологии высшей нервной деятельности)
    Моделирование процессов в нейронных сетях с четным циклическим торможением

По итогам выступлений на конференции следующие студенты получают за экзамен оценку “отлично”:

  • Галков Максим Дмитриевич, каф. физиологии животных и человека
  • Четыркина Маргарита Руслановна, каф. физиологии животных и человека
  • Довбнюк Ксения Олеговна, каф. физиологии животных и человека
  • Миловская Ирина Георгиевна, каф. биохимии
  • Табачник Алексей Константинович, каф. зоологии беспозвоночных
  • Карачевцева Маргарита Алексеевна, каф. биоинженерии
  • Вьюшков Владимир Сергеевич, каф. молекулярной биологии
  • Босая Анастасия Александровна, каф. биоорганической химии
  • Фролова Вероника Сергеевна, каф. эмбриологии
  • Устинова Елена Николаевна, каф. биологической эволюции
  • Шнайдер Элина Дмитриевна, каф. генетики
  • Манюхина Виктория Олеговна, каф. высшей нервной деятельности
  • Евтушенко Надежда Алексеевна, каф. высшей нервной деятельности

Выбор – оценка «хорошо» или пойти на досрочный экзамен – предоставляется следующим студентам:

  • Черных Михаил Александрович, каф. биоинженерии
  • Володина Ася Владиславовна, каф. вирусологи
  • Шлык Валерия Ивановна, каф. молекулярной биологии

Оценка не поставлена, но предоставляется возможность досрочной сдачи экзамена студенту

  • Лукьянову Даниилу Константиновичу, каф. биохимии

Конференция, прошедшая 21 и 22 апреля 2015 года

  • Голяко Иван Александрович, Подшивалова Елизавета Сергеевна (Кафедра физиологии животных, группа 209)
    Математическая модель реконструкции костной ткани
  • Колотова Дарья Евгеньевна, Новичихина Клара Васильевна (Кафедра физиологии животных, группа 209)
    Исследование модели "Гипофиз - щитовидная железа"
  • Короткова Дарья Дмитриевна, Гольцова Александра Сергеевна (Кафедра эмбриологии, группа 212)
    Моделирование процессов регенерации
  • Абрикосова Виктория Александровна, Гарифулина Александра Игоревна (Кафедра биоорганической химии, группа 220)
    Математическое моделирование опухолевых новообразований
  • Шиян Александра Сергеевна (Кафедра зоологии беспозвоночных, группа 202)
    Изучение динамики численности популяций двух видов пещерных мизид при помощи модели конкуренции видов
  • Веко Егор Николаевич, Пронкина Кира Олеговна (Кафедра энтомологии, группа 204)
    Исследование динамики численности каст муравьев в модели симбиоза
  • Алемасцева Екатерина Алексеевна (Кафедра генетики, группа 213), Ветрова Александра Александровна (Кафедра эмбриологии, группа 212)
    Анализ численности австралийских крокодилов с температурной детерминацией пола
  • Большакова Алиса Андреевна, Дубровская Анна Сергеевна (Кафедра зоологии позвоночных, группа 201)
    Статистическая модель для оценки случайности совпадения песенной активности двух особей разных видов птиц
  • Мищанчук Ксения Александровна, Шепелева Екатерина Андреевна (Кафедра высших растений, группа 207)
    Прогнозирования начала цветения Betula sp.
  • Шадрин Валериан Сергеевич, Шошина Олеся Олеговна (Кафедра биологической эволюции, группа 221)
    Математическая модель бактериального мата
  • Бутаева Галина Булатовна, Голубева Александра Игоревна (Кафедра альгологии и микологии, группа 206)
    Кинетика модели проточного культиватора и биологические причины инерции
  • Найденкова Анастасия Дмитриевна (Кафедра зоологии беспозвоночных, группа 202), Торговкина Софья Михайловна (Кафедра физиологии высшей нервной деятельности, группа 210)
    О синхронизации в нейронной сети на основе модели электрического синапса
  • Трошев Дмитрий Вадимович (Кафедра физиологии высшей нервной деятельности, группа 210), Пискарева Арина Алексеевна (Кафедра биоинженерии, группа 226)
    Исследование колебательных процессов регуляции синтеза белка
  • Грибкова Анна Кирилловна, Маттис Мария Андреевна (Кафедра биоинженерии, группа 226)
    Исследование положительных обратных связей через кофакторы в процессах свертывания крови. Математическая модель Семенова и Ханина
  • Гринченко Варвара Дмитриевна, Щёлоков Дмитрий Александрович (Кафедра биоинженерии, группа 226)
    Кооперативные явления ферментативной кинетики
  • Воробьева Виктория Алексеевна, Рябкова Наталья Сергеевна (Кафедра биохимии, группа 218)
    Регуляция синтеза белка и блокирование гена
  • Слонимский Юрий Борисович (Кафедра биохимии, группа 218)
    Математическая модель регуляции прогестерона и лютеинизирующего гормона
  • Кочерыжкина Елена Владимировна, Пирогов Сергей Александрович (Кафедра молекулярной биологии, группа 219)
    Стохастическая модель транскрипции с отрицательной обратной связью с учетом димеризации белка
  • Маслов Иван Олегович, Федорина Анастасия Сергеевна (Кафедра биоорганической химии, группа 220)
    Исследование динамики концентрации связанных тиреоидных гормонов в наружном слое фолликула щитовидной железы
  • Матюлько Ирина Сергеевна, Мигулина Наталия Алексеевна (Кафедра физиологии животных, группа 209)
    Математическая модель регуляции энергетического обмена действием лептина у мышей
  • Деревянко Полина Константиновна, Козлова Анастасия Львовна (Кафедра молекулярной биологии, группа 219)
    Разработка алгоритма поиска генетических маркеров, дискриминирующих заданную выборку организмов
  • Бортников Федор Михайлович (Кафедра альгологии и микологии, группа 206)
    Механохимическая модель амебоидной подвижности плазмодия Physarum polycephalum
  • Стурова Анна Игоревна (Кафедра физиологии животных, группа 209)
    Модель сокращения скелетной мускулатуры

 

Материалы конференции, прошедшей 22, 23, 25 и 29 апреля 2014 года

Часть 1
» Видеозапись (YouTube)
» Видеозапись (AVI)
» Аудиозапись (MP3)

  1. Дудорова Анастасия Валерьевна (Зоология позвоночных)
    Исследование динамики численности рыжей полевки с помощью функций последования
  2. Горелышева Дарья, Неклюдов Борис (Зоология беспозвоночных)
    Отбор циклов с периодом - простым числом в модели «хищник-жертва» с использованием методов компьютерного моделирования
  3. Богатырева Варвара (Энтомология)
    Модель начальных этапов построения термитника
  4. Бухтоярова Наталья Юрьевна (Микология и альгология)
    Математическое моделирование культивируемой популяции одноклеточной водоросли Chlorella vulgaris
  5. Карпунина Полина Владимировна (Высшие растения)
    Моделирование филлотаксиса вегетативных побегов
  6. Абрамов Евгений Александрович, Голикова Екатерина Андреевна (Физиология человека и животных)
    Регуляция гемопоэза

Часть 2
» Видеозапись
» Видеозапись (AVI)
» Аудиозапись (MP3)

  1. Иванова Александра, Суханова Любовь (Физиология человека и животных)
    Математическая модель гемодинамики элементарного сосудистого участка
  2. Леонидова Светлана Валерьевна, Молчанова Татьяна Александровна (Физиология человека и животных)
    ВИЧ: моделирование комбинированной лекарственной терапии
  3. Аксёнова Юлия, Брошевицкая Надежда Дмитриевна (Физиология высшей нервной деятельности)
    Исследование механизма генетического заболевания анальгезии на основе модели Ходчкина-Хаксли
  4. Полищук Александра Андреевна, Федотова Анна Алексеевна (Физиология высшей нервной деятельности)
    Моделирование неспецифического переключения в сигналах электрической активности головного мозга
  5. Солодков Роман Викторович (Физиология высшей нервной деятельности)
    Модель динамики частоты сердечных сокращений в условиях физической нагрузки
  6. Басалова Наталья Андреевна, Капитанова Ксения Сергеевна, Матвеева Татьяна Валерьевна (Клеточная биология и гистология)
    Модели в геронтологии. Общие теории старения

Часть 3
» Видеозапись
» Видеозапись (AVI)
» Аудиозапись (MP3)

  1. Хамидуллина Альвина Ильвировна, Ялчина Рената Салаватовна (Клеточная биология и гистология)
    Математическое моделирование острой воспалительной реакции
  2. Золотарева Татьяна Александровна, Конеева Цаган Олеговна (Эмбриология)
    Структурообразование при формировании зубов у A. mississippiensis
  3. Коробко Екатерина Сергеевна (Эмбриология)
    Модель самоорганизации эмбриональных клеточных пластов
  4. Паршина Елена Анатольевна (Эмбриология), Силина Виктория Валерьевна (Генетика)
    Математическая модель Maini «часов и волны» на примере сомитогенеза
  5. Лавренова Виктория (1 курс)
    Исследование модели «хищник – две жертвы»
  6. Костюк Александр Игоревич (Биохимия), Белоусова Юлия Владимировна (Физиология человека и животных)
    Морфологический и молекулярно-филогенетический (ярДНК ITS1, 5.8s rRNA, ITS2 ) анализы мятликов (Poa) в связи с их систематикой и диагностикой

Часть 4
» Видеозапись
» Видеозапись (AVI)
» Аудиозапись (MP3)

  1. Лопатухина Елена Владимировна (Биохимия)
    Динамика распространения эпидемий
  2. Зинина Валерия Вадимовна, Свешникова Анастасия Александровна (Молекулярная биология)
    Моделирования белков на примере ядерного рецептора CAR и его лиганд-рецепторных комплексов
  3. Миляева Полина Андреевна (Генетика)
    Нейтральная теория молекулярной эволюции
  4. Пылова Наталья Игоревна (Генетика)
    Моделирование кинетики индуцибельных белковых комплексов SOS-системы бактерий E. coli
  5. Никишова Екатерина (Гидробиология)
    Модель биологической очистки почвы и зоны аэрации от загрязнения нефтепродуктами

Часть 5
» Видеозапись
» Видеозапись (AVI)
» Аудиозапись (MP3)

  1. Белова Вера Александровна (Генетика)
    Моделирование генных сетей
  2. Ибнеева Лилия Ренатовна (Биохимия)
    Математическая модель работы АТФ-синтазы как вращающегося молекулярного мотора
  3. Гиголаев Андрей Михайлович, Полянина Дарья Леонидовна (Биоорганическая химия)
    Математическое моделирование кальциевого гомеостаза в гладкомышечных клетках в условиях модуляции активности кальциевого насоса плазматической мембраны
  4. Воробьева Екатерина, Войтова Маргарита (Микробиология)
    Модель Моно и ее применение в микробиологии
  5. Зыкова Анна Андреевна, Стрелкова Дарья Михайловна (Вирусология)
    Хронические вирусные инфекции клеточных популяций

Часть 6
» Видеозапись
» Видеозапись (AVI)
» Аудиозапись (MP3)

  1. Ефимова Дарья (Биоинженерия)
    Фолдинг белка
  2. Гебрук Анна (Зоология беспозвоночных)
    Первоописание и 3D реконструкция предротового целома брахиоподы Lingula anatina. 3D реконструкция: видео
  3. Борисова Полина (Зоология беспозвоночных)
    Метод геометрической морфофометрии и его эффективность по сравнению с классической морфометрией
  4. Воробьева Ольга (Зоология беспозвоночных)
    Возможности анализа состояния конституционного гетерохроматина генома человека с помощью цифровых технологий
  5. Земледельцев Денис (Зоология беспозвоночных)
    Поиск протяженных повторов в геномах на основе спектрально-аналитического метода
  6. Тарасов Кирилл (Биоинженерия)
    Математическое моделирование пространственно-временной динамики возрастной структуры популяции растений
  7. Зайцев Пётр (Биоинженерия)
    Иммобилизация флуоресцентного зонда в молекулы фермента
  8. Рябых Григорий (Биоинженерия)
    О фракталах

Часть 7
» Видеозапись
» Видеозапись (AVI)
» Аудиозапись (MP3)

  1. Глущенко Евгений (Биоинженерия)
    Клеточные автоматы против классических систем дифференциальных уравнений. Статья: First replicating creature spawned in life simulator
  2. Филиппова Екатерина (Биоинженерия)
    Математическая модель стрессового клеточного ответа на накопление неправильно свернутых белков в эндоплазматическом ретикулуме
  3. Михайлова Мария (Биоинженерия)
    Исследование системы Фитцхью и Нагумо
  4. Соколова Анастасия (Биоинженерия)
    Анализ модели иммунного ответа на вирусную инфекцию
  5. Илларионова Анастасия (Биоинженерия)
    Модель развития солидной опухоли
  6. Титов Алексей (Биоинженерия)
    Биотехнология в рамках модели Моно
  7. Савельева Мария (Биоинженерия)
    Рост опухоли

Часть 8
» Видеозапись
» Видеозапись (AVI)
» Аудиозапись (MP3)

  1. Сидоров Андрей (Биофизика)
    Триггер Жакоба и Моно. Модель биохимической регуляции белкового синтеза
  2. Боков Максим (Биофизика)
    Нейронная модель Фитцхью и Нагумо
  3. Жуков Олег (Биофизика)
    Колебания концентрации кальция в гепатоцитах печени. Исследование модели
  4. Дубянская Евгения, Хомич Дарья (Биофизика)
    Модель клеточного цикла
  5. Кулешов Павел, Буруева Жибзема (Биофизика)
    Исследование модели Майнхарда-Гирера
  6. Моисеенко Денис (Биофизика)
    Модели регуляции активности оперона с отрицательной обратной связью

 

Материалы конференции, прошедшей 23 апреля 2013 года

 

Материалы конференции, прошедшей 18 апреля 2012 года