Галина
Юрьевна
Ризниченко

Биоинформатика и математическое моделирование

Современную биологию невозможно представить без математических и компьютерных методов. Их применение способствовало пониманию законов, лежащих в основе биологических процессов. Одновременно биологические задачи инициировали создание новых математических теорий, которые обогатили саму математику.

На сайте представлен курс лекций, читаемый автором для студентов бакалавриата Биологического факультета МГУ имени М. В. Ломоносова (2-ой год обучения, осенний семестр). Курс включает 16 лекций и 16 семинаров (практических занятий), в ходе которых студенты закрепляют полученные на лекциях знания и знакомятся с программным обеспечением, используемым для анализа математических моделей и проведения вычислительных экспериментов. Часть задач, предлагаемых студентам, доступна в виртуальной лаборатории на сайте.

Материал курса можно условно разделить на три части:

  • Введение в математическую биологию
    Рассматриваются базовые понятия математического моделирования, на примере простейших систем анализируются основные закономерности их поведения. Основное внимание уделяется не самой биологической системе, но тем подходам, которые использованы для содания её модели.
  • Модели сложных биологических систем
    В этой части фокус перемещается на собственно биологические проблемы. На ряде примеров рассматриваются различные подходы, которые используются при создании моделей сложных биологических систем и процессов.
  • Биоинформатика и молекулярное моделирование
    Даётся обзор сетевых баз данных и способов работы с ними. Рассматриваются методы, используемые в молекулярной биологии для анализа и сравнения нуклеотидных и аминокислотных последовательностей, и методы молекулярного моделирования.

Учебный план по курсу «Биоинформатика и математическое моделирование» включает:

  • посещение лекций;
  • выполнение заданий на семинарах;
  • выполнение домашних заданий;
  • написание 3-х контрольных работ;
  • ответы на вопросы лектора на форуме (по желанию, но обязательно для участия в конференции).

В течение семестра за разные типы работ студент получает баллы, на основании которых преподаватель семинаров ставит общую оценку за работу в семестре. После прохождения курса студенты сдают экзамен.

Материал курса издан в виде учебника: Ризниченко Г. Ю. Лекции по математическим моделям в биологии (изд. 2-е, испр. и дополн.) Издательство РХД, 2011 г. 560 стр. ISBN 978-5-93972-847-8. Список других учебных пособий и дополнительных ресурсов по курсу Вы найдёте на соответствующей странице сайта.